1．邓树增主编．自然辩证法引论．（吴彤，参编第二章，2-3万字）湖南大学出版社1987年版。
2．许志峰主编．现代科学技术与当代社会．（吴彤，参编第一、二章，3万字）东北师范大学出版社1991年版。
3．徐文华主编．科学哲学新编．（吴彤参编第十六章，1万字）中国广播电视出版社1990年版。
4．国务院发展研究中心．跨世纪战略发展过程中的中国经济结构研究．（吴彤参编第30章，（第3作者））经济科学出版社1998年版。
5．吴彤．自组织方法论研究．清华大学出版社．2001年版。
6．吴彤．生长的旋律——自组织演化的科学．（13.4万字），山东教育出版社1996年版。
7．吴彤．多维融贯——系统分析与哲学思维方法．昆明：云南人民出版社．2005年版．
8．吴彤. 三生万物——自组织、复杂性和科学实践（个人文集），呼和浩特：内蒙古人民出版社，2006年版。
9．吴彤、张锡梅、任玉凤、李笑春．人与自然．生态、科技、文化和社会．（28万字）内蒙古大学出版社1995年版。
10. 吴彤。复杂性的哲学探索。内蒙古人民出版社，2008年版。
11．沈小峰、吴彤、曾国屏．自组织的哲学——一种新的自然观和科学观．（32万字），中共中央党校出版社，1993年版。
12．吴彤编著．现代科学技术与当代社会．(28万字)，内蒙古大学出版社1998年版。
13．吴彤、蒋劲松、王巍主编．科学技术的哲学反思．北京：清华大学出版社．2004年版。
14．吴彤．复杂性的科学哲学探索．呼和浩特：内蒙古人民出版社．2008年版。
15. 曾国屏、高亮华、刘立、吴彤、李正风．当代自然辩证法教程．北京：清华大学出版社．2006年版。